1999年7月，在国务院《地质勘查队伍管理体制改革方案》的指导下，由上海市地质勘查技术研究院和上海市城市地质研究院强强联合，组建了上海市地质调查研究院。
　　上海市地质调查研究院直属上海市规划和国土资源管理局，是上海地区专门从事地质科研与应用的唯一事业单位。我院主要从事基础性、战略性、综合性地质调查和上海地区地质环境监控。涉及环境地质、水文地质、工程地质、地球物理、地球化学、测绘、遥感、信息技术等多个专业。。相关专业及职能如下：
1、地面沉降----上世纪60年代以来，上海发生了严重地面沉降，给城市发展和社会生活带来了很大的影响，并造成非常大的经济损失，引起市政府的高度重视。几十年来，我院广大地质工作者潜心研究造成上海地面沉降的因素、机理和规律，近年来，更注重预防与治理相结合，形成了比较完整的地面沉降调查、监测与治理体系，为中国地面沉降防治工作提供了宝贵经验。
2、地下水资源----为进一步加强地下水资源开发与地质环境保护工作，在中国地质调查局的支持下从长江三角洲流域高度开展了上海市地下水资源评价工作，进一步查明了地下水资源的开发现状与资源潜力；同时，我院配合上海市供水规划编制了“上海市地下水开发利用规划”，在进一步加强地面沉降防治的前提下，合理利用地下水资源。
3、地质环境----上海地区不同地质结构单元的地质条件具有较大差异，综合评价地质环境对上海的总体规划和建设具有重要意义。2004年4月24日，国土资源与上海市人民政府在上海签署了“上海市三维城市地质调查”的合作协议，并落实由我院具体承担完成，意在构建三维可视化城市地质信息平台，全面分析地质环境对重大工程的选址与建设尤其是地下空间开发的制约与影响，更好地服务于城市的长远发展。
4、地质灾害防治与评估----地质灾害是指由自然因素或人为活动引发的危害人民生命和财产安全的与地质作用有关的灾害。建设工程地质灾害危险性评估的目的旨在对工程拟建场区已有或潜在的地质灾害进行调查，分析地质灾害对规划建筑设施可能产生的影响，评价工程建设加强或诱发地质灾害的可能性，并提出对策。
5、测试----为适应国土资源依法行政、调查、规划利用及管理需要，我院负责具体筹建了“国土资源部上海国土资源环境监督检测中心”，购置了原子吸收分光光度计、紫外可见分光光度、气相色谱、离子色谱等分析仪器，建立了计量认证体系，具备了适合于上海国土资源环境监、调查与评价的测试能力。
6、工程物探----在地下管线、障碍物调查工作中，我院充分发挥城市地球物理勘查的专业优势，利用国外引进的各类先进设备如探地雷达、管线探测仪、浅地震等，在上海重大市政工程建设中作出了重要贡献。
7、工程测量----近年来，充分利用GPS等高新技术广泛应用于大地测量、基础地形地籍测绘、工程测量、地面沉降、河道测量及隧道贯通测量等，达到事半功倍的效果。为进一步推广GPS技术在房地产测绘的应用，我院配合上海市房屋土地资源管理局建立了“上海市房地产权籍调查GPS控制网“，充分展现了GPS技术全天候、实时、高精度的优越性。
8、自动化监测----由我院自主研发的三维变形自动化监测系统采用CEOSCOPE软件及数据处理系统，可进行实时数据采集、计算、存储管理、图表输出，工程管理、施工部门通过网络实时掌握工程建设中三维变形动态。
9、信息技术----我们成功研制了《工程地质信息系统》、《地面沉降信息系统》。2004年4月，国土资源与上海市人民政府在上海签署了“上海市三维城市地质调查”的合作协议，合作开展城市地质调查，构建三维可视化城市地质信息平台，届时，地质信息将全方位、一览无余服务于上海市规划、选址、建设与管理。
10、土地调查与规划----我院在上海市房屋土地资源管理局相关处室的指导下，承担了上海市耕地后备资源调查、上海市土地利用总体规划环境影响评价、上海市权籍调查GPS控制网建设等工作，充分发挥了我院调查及综合评价方面的技术优势。

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